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원장칼럼

제목 유전자 발현배열분석을 이용한 유방암의 분자프로파일링 2023-09-01

https://blog.naver.com/gogngs/223199804878 

 

 

DNA 미세배열분석법은 종양생물학을 더 잘 이해하고 치료의 결과와 반응을 예측하기 위한 수단으로 사용되어 왔다.

유전자 발현 미세배열분석은 초기 참고샘플들과 비교할 수 있거나 다른 종양 또는 정상 조직들과 직접 비교할 수 있는 mRNA 전사체들의 단계를 양적으로 결정하기 위해 특정 유전자 발현단계를 평가한다.

최근 분석들은 본질적으로 수천 수백만 가지의 특징을 갖는 올리고핵산염들 또는 PCR증폭된 cDNA 삽입체들 중 한 가지의 탐침자와 관련된 모든 인간 유전자들을 포함한다.

인간 게놈은 약 37,000개의 유전자가 있다.

종양은 DNA나 RNA 둘 중 하나를 발현시키는 데 사용되는 상보적인 RNA를 포함하는데 이는 형광탐침으로 밝혀진다.

이러한 형광탐침자는 단독유전자분석은 단색분석법을 직접적으로 적용되거나 이차적인 형광 발산을 조합한 것이다.

이차적인 형광미세배열분석은 2색분석법으로, 관례상 '적색'은 관심표본에 사용되고, '녹색'은 참고표본에 사용되며 정상조직에 비하여 암조직에서 '녹색'신호는 낮은 발현을 보이고 '적색' 신호는 높은 발현을 보인다.

분석의 마지막 과정은 기본적으로 Southern blot으로서 , 핵산융합반응 발생과 종양 mRNA의 상대적인 양을 반영하는 개별적 유전자 탐침자를 융합하는 핵산의 밀도를 측정한다.

따라서 두 색깔 분석에서 색깔의 의미는 가장 높은 종양의 발현 값이 아닌 그 유전자의 양적 측정에 사용되는 각각의 유전자에 대한 종양/참고치의 비율이며, 종양과 종양의 비교 , 그리고 종양과 정상조직의 비교에 사용된다.

2색 미세배열분석은 종양/참고치 비율값을 나타내고, 단색 미세배열분석에서는 발현되는 유전자의 절대적 밀도값을 의미한다.

대부분의 유방암 유전자 프로파일링 연구들은 mRNA 발현에 초점이 맞춰져 있다.

유방암의 분자적 프로파일링은 다음 세 가지 주요한 질문들에 대한 중요한 정보를 제공한다.

가. 생물학적 차이에 기반한 고유한 아형이 유방암에서 존재하는가 ?

나. 종양의 나쁜 혹은 좋은 예후를 구분함으로써 보조치료제를 더 잘 선택할 수 있게 해주는 유전자 발현 프로파일이 존재하는가?

다. 특정 치료에 대해 어떤 종양이 반응할지 예측하게 해주는 유전자 발현 프로파일이 존재하는가 ?